Spillere, der spiller 'EteRNA', slår bare professionel videnskab til denne vigtige opdagelse

Citizen science gik bare på næste niveau: Videospillere har lavet en biologisk opdagelse, og den er nu blevet offentliggjort af et peer-reviewed videnskabelige tidsskrift.

Udgivet denne uge i Journal of Molecular Biology, en række intuitivt udviklede regler for, hvor svært en bestemt form vil være at opnå gennem RNA-design. De fandt for eksempel, at jo mere symmetrisk en form er, desto sværere vil det være at designe en RNA-streng for at matche den.

Kollektivet af videospillere gjorde opdagelsen ved at spille, Eterna, et spil, der udfordrer spillere til at tage tråde af RNA og folde dem ind i en ønsket form ved at ændre deres kemiske makeup. Det videnskabelige problem med at folde RNA i en bestemt form er kompleks, men spillet er ikke - ingen forståelse for biokemi er nødvendig for at begynde at spille.

Spillerne tog op på forskningsspørgsmålet på eget initiativ som en måde at give nyere spillere værktøjer til at bedømme den relative vanskelighed ved forskellige puslespil. Resultaterne vil hjælpe med at styre fremtidig biomedicinsk forskning, da det nye sæt regler giver videnskabsmænd en bedre fornemmelse af, om det ikke er en forgæves øvelse at forsøge at folde RNA i en given form.

"Denne forskning tyder på, at standardparadigmet for videnskabelig crowdsourcing kan vendes," siger Rhiju Das, professor i biokemi ved Stanford, Inverse i en email. Eterna blev lanceret i 2011 af Das og Adrien Treuille, assistent professor i computervidenskab på Carnegie Mellon University. ” Eterna Spillerne kan udtænke deres egne forskningsspørgsmål og kan skrive deres egne papirer. I denne undersøgelse var der en lille vejledning og uafhængig test fra eksperter i mit laboratorium."

Syntetiseret RNA har et utroligt potentiale for en ny generation af stoffer og medicinske terapier. Hvis den kan foldes i den rigtige form, kan RNA bygges til at målrette mod bestemte vira, kræftformer og endda genetiske lidelser. CRISPR, en genredigeringsproces, der dramatisk ændrer fremtidens menneskelige eksistens, bruger RNA til at lede det DNA-skærende enzym, Cas9, til den uønskede del af DNA.

Eterna startede som et forum for ekspertforskere til at præsentere puslespil til spillerne, men det er siden vokset ud over det. Spillet og dets 100.000 registrerede spillere eksisterer nu i et symbiotisk og udviklende forhold med professionelle forskere og computer modeller bygget til at designe og teste RNA struktur.

"Computer modellering og Eterna er ikke eksklusive, "siger Das. ” Eterna samler mange mennesker, hvoraf nogle skriver deres egne computermodeller."

I det nuværende papir skrev spillerne sammen scripts for at teste deres ideer til, hvad der gør RNA strukturer vanskelige at designe. Das siger, at nogle spillere fortalte ham, at de er særligt glade for at automatisere deres ideer til computermodeller, fordi de vil fortsætte og løse hårdere problemer.

Problemer opbygget af Eterna Spillerne bliver i færd med at blive syntetiseret i Das 'lab - indtil videre er der blevet bygget 86.449 spillergenererede sekvenser IRL.

Forfatterens forfattere var Eterna spillere Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju og Michelle Wu. Wu er også en ph.d. studerende i biomedicinsk informatik i Stanford.

I fremtiden kan det være, at borgereksperter begynder at offentliggøre videnskabelige opdagelser helt uafhængigt.

"Denne" flippede crowdsourcing "-skabelon for borgervidenskab kan være nyttig for andre projekter og områder inden for videnskab, såsom astronomi (Galaxy Zoo) eller identifikation af menneskeskabte arter (Barcode of Life), "Siger Das. "Især hvis de, som Eterna, ser flaskehalse på scenen for papirskrift."